Word [Word](2013) スタイル関連の用語を整理する
Wordの書式設定を理解するための用語を整理する。Webの情報を読むと、スタイル、クイック スタイル、スタイル ギャラリー、クイック スタイル ギャラリー、スタイル セット、クイック スタイル、スタイル セット ギャラリー、クイック スタイ...
Word 因子分析 n因子モデルとn次因子モデル
定義n因子モデル(１因子モデル、２因子モデル、・・・）は因子数n個を想定した因子分析モデルのことである。n次因子モデルは、因子にn次の階層構造を想定した因子分析モデルのことである。例えば（下位の）因子1、因子2、因子3が（上位の）因子Xによ...
クローバーの社 ご近所で不動産バブルを体感する（文京区）
2016年5月8日現在、東京では不動産バブルが進行中である。ご近所の物件でまさにそのバブルっぷりを体感できるものがあったので記録として残しておきたい。アールヴェール文京白山という本駒込一丁目（南北線本駒込駅徒歩１分）の物件である。2013年...
プログラミング備忘録 FileMaker Pro でデータベースを共有する方法（まとめ）
FileMaker Proで作成したデータベースをネットワークで共有する方法にはどのようなものがあるのか。FileMakerのバージョンアップにより廃止された機能があったりしてわかりにくい。FileMaker Proのデータベースを共有する...
観察的研究 心理尺度の開発手順
心理尺度は一般的に以下の手順で開発される。 項目作成 予備調査 本調査項目作成心理尺度のドラフト（叩き台）を開発する段階である。検査目的に相応しいと考える項目を作成する。ブレインストーミングや関連する既存尺度の項目を参考にして項目のリスト(...
{base} [R]{base} subset() : ベクトル、マトリックス、データフレームから一部を選択抽出する(ジェネリック関数)
説明ベクトル、マトリックス(行列)、データフレームから指定した条件を満たす一部（サブセット）を返すジェネリック関数である。大きく一次元のデータであるベクトルに対するsubset()と二次元のデータである行列、データフレームに対するsubse...
R言語 [R] Rにおけるオブジェクトとは何か？
Rではコンピュータのメモリに直接アクセスすることができない。従って間接的にメモリ上のデータを読み書きする何らかの仕組みが必要となる。この間接的にメモリ上のデータの読み書きを行うためのR言語独自の仕組み（インターフェース）を、Rでは"オブジェ...
R言語 [R] NA, NaN, NULL
NULL, NaN, NAこの３つの予約語はいずれも非存在（不在、欠損）を表すRの予約語である。紛らわしいがRでは違う意味を持っており使い分けられる。予約語意味NANot Availableの略。欠損値を表す。データファイルなどを読みこんだ...
R言語 [R] 予約語 (reserved words)
予約語(reserved words)とは、R言語の仕様として予め特別な意味と役割が定められた文字列のことである。予約語はユーザーが定義する関数名、変数名などとしては使用できない。具体的には以下の予約語がある。if else repeat ...
{graphics} [R]{graphics} hist() : ヒストグラム（頻度表）を描画する関数
説明graphics::hist()は指定されたデータを元に頻度表を計算するジェネリック関数である。通常の使用法とにかく頻度表を作成するには、以下のように記述すればよい。hist(頻度表を作成するデータのベクトル)頻度表の定義や描画方法をカ...
{graphics} [R]{graphics} par() : グラフィカル・パラメータの設定あるいは取得
説明graphics::par()を使用するとグラフィカル・パラメータの設定あるいは取得をすることができる。グラフィカル・パラメータはpar()に対する引数として指定する。その際の引数は、(1)タグ＝値という形式、(2) タグ＝値を１要素と...
生存時間分析 生存曲線の交差(crossing hazards)
同義語生存曲線の交差、crossing hazards定義crossing hazardsとは、キャプランマイヤー曲線において、群間の生存曲線が交差する現象のことである。crossing hazardsは、(1)統計解析、(2)臨床、２つの...
Simplicity Simplicityで箇条書きのフォントサイズ、行間を変更する方法(CSS)
Simplicityでは箇条書きをするとフォントサイズが小さく、行間が詰まって表示されるのが気になっていた。記事本文のデフォルトの表示は気に入っていたので、箇条書きにおいても同じフォントサイズ、行間に設定することにした。公式掲示板によれば、...
仮説検定 多重検定の問題（検定の多重性の問題）
定義多重検定の問題（検定の多重性の問題）とは、１回ならαエラーを犯す確率の低い検定であっても、複数回繰り返すと偽陽性の推測(false positive inference)の回数も増えてしまう問題のことである。（なお１回の検定でαエラーを...
3次予防(治療) 毒性プロファイル(toxicity profile)
定義１つの治療に伴う毒性（有害事象）は様々なものがある。毒性プロファイル(toxicity profile)とは、ある毒性が強く、他の毒性は弱い、というようなある治療の毒性の全体的特徴のことである。関連paper toxicity
3次予防(治療) paper toxicity
定義paper toxicityとは、治療に伴う毒性のうち、臨床検査などで検出されるが、患者の主観的体験には全く影響を及ぼさないもののことである。例えば抗癌剤投与に伴う軽度の好中球減少などはpaper toxicityの例である。
研究デザイン ITT(intention-to-treat)の原則
同義語治療意図(intention to treat, ITT)定義ITT(intention-to-treat)の原則とは、比較試験のデータ解析の際に、群の分類を、実際に受けた介入ではなく、割り当てられた介入によって決める原則のことである...
薬物辞典 抗がん剤の略語
肺がん領域略語正式名称CDDPcisplatinCBDCAcarboplatinPEMpemetrexedDOCdocetaxelIP療法CDDP+irinotecanTC療法CBDCA+paclitaxelGP療法CDDP+gemcita...
研究デザイン true endpoint (真のエンドポイント)
同義語clinical endpoint(臨床的エンドポイント)定義true endpoint(真のエンドポイント)とは、患者の利益を直接反映する変数（指標、アウトカム）のこと。(里見 2011)は、true endpointは "long...
研究デザイン control arm (CA)
定義control armとは比較試験において、関心のある治療に割り付けられた群ではなく、これと比較対象となる群のことである。例えば、治療法の研究であれば、新治療法がstudy arm、その時点の標準治療がcontrol armとなる。関連...
その他アプリ [Adobe Flash] FLVとSWFの違いは何か？
FLVとSWFはいずれもAdobe Flash（アドビシステムズ社が開発した動画やゲームなどを扱うための規格）で使用されるファイル形式である。そのまま拡張子にもなっている。簡単に違いを言えば、FLVは単なる動画ファイルであるのに対し、SWF...
研究デザイン study arm (SA)
定義study armとは比較研究において、新たに検討したいと思っている介入（新しい治療法など）に割り付けられた群を指す用語である。関連control arm(CA)
医学辞典 Plummer-Vinson症候群 (Plummer-Vinson syndrome)
概要 鉄欠乏性貧血、嚥下困難、食道ウェブを特徴とする症候群。(*)食道ウェブ(esophageal webs) : 上・中食道に位置する薄い粘膜。 閉経後女性に多い。今日では非常にまれ。 原因は不明。低栄養が関与すると考えられている。症状ま...
研究デザイン 疫学研究デザインの分類
疫学研究の介入の有無、群間比較の有無、横断/縦断、研究対象の４つの観点から以下のように整理可能である。記述疫学研究観察or介入群間比較横断or縦断研究対象症例研究（報告）観察無横断個人症例集積研究観察無横断個人診療実態研究観察無横断個人分析...
研究デザイン 症例対照研究 (case-control study)
同義語ケースコントロール研究 (case-control study)、症例対照研究(case-control study)、ネステッド症例対照研究(nested case-control study)定義症例対照研究は以下の手順で進められ...
研究デザイン コホート研究 (cohort study)
定義コホート研究(cohort study)とは、１つ以上のコホート内における疾病の発生を測定する研究デザインである。「全ての疫学研究の原型」（ロスマン）であり、縦断研究の１種である。コホート研究の分類分類１：前向き vs 後ろ向きコホート...
Web ブログ運営のためのWeb情報源
ブログ収益化Googleアドセンス（ブログ収益化の基本）A8.net（日本の老舗アフィリエイト）検索エンジン対策Google Seach Console（Google 検索結果でのブログのパフォーマンスを監視、管理）ブログのパフォーマンス・...
医学辞典 喘息の吸入器 (MDIとDPI)
喘息の吸入器には多くの種類があるがMDI(Metered Dose Inhalers)とDPI(dry powder inhaler)に大別される。両者の違いは、薬をガスの力で噴射するか、自分の呼吸で吸い込むか、という点である。MDIは小型...
{base} [R]{base} rowMeans() : データフレームの複数行の行平均を一括計算する
説明データフレームやマトリックに対して、複数行の行平均を一発で計算する。使用法（通常）欠損値を除外して平均値を算出する場合rowMeans(データフレーム、na.rm = TRUE)欠損値を除外しない場合（＝欠損値を含む場合「NA」が返る）...
{psych} [R]{psych} describeBy() : グループごとに要約統計量を出力する関数
説明グルーピング変数ごとに要約統計を出力する。使用法（通常）describeBy(データフレーム、グルーピング変数)使用法（詳細）describeBy(x, group=NULL,mat=FALSE,type=3,digits=15,......
研究デザイン ランダム化（無作為割付）
同義語ランダム化、無作為割付、randomize定義ランダム化とは、研究対象を群分けして、どのような介入をどの群に対して行うかを、無作為に決定すること。原始的にはくじ引き、乱数表などを使用して行われていたが、現在では洗練されたコンピュータア...
研究デザイン 盲検化(masking)
同義語盲検化、マスク化、masking定義盲検化とはある患者が介入群が、対照群であるかをわからなくする方法である。RCTにおけるバイアス対策の１つである。盲検化は、一重盲検化(single masking)、二重盲検化(double mas...
疫学指標(検査・診断) 診断法の研究の指標：感度(sensitivity)、特異度(specificity)
診断法の研究はリサーチクエスチョンの構造、研究デザインともに同時の形態を持つ。従って研究結果を要約する指標もまた独自のものを持つ。具体的には感度(sensitivity)、特異度(specificity)が重要である。分割表に基づいて感度、...
疫学指標(因果的効果) 絶対リスク減少 (absolute risk reduction)
定義絶対リスクの差の総称。絶対リスクそのものが、発生割合（＝リスク）や発生率の総称であることから、絶対リスク現象も発生割合や発生率の差ということになる。総称であるため意味が曖昧になるおそれがあるので、可能な限り特異的な用語を用いるべきである...
疫学指標(因果的効果) 相対リスク (relative risk)
同義語相対リスク、相対危険、relative risk定義相対リスク(relative risk)は、絶対リスク（リスクや発生率）の比である。即ちリスク比、発生率比の総称である。絶対リスク同様相対リスクも総称であるため、意味の曖昧さが残る用...
疫学指標(因果的効果) NNT (Number Needed to Treat)
定義NNTは絶対リスク減少(absolute risk reduction)の逆数である。NNTに相当する人数を治療すると１人のイベント発生を防げると解釈する。治療以外に、予防、診断に概念を拡張することもできこれらの場合、Number Ne...
疫学指標(因果的効果) オッズ比 (Odds ratio)
定義オッズ比はケースコントロール研究において、コホート研究におけるリスク比の代用として計算される指標である。分割表で定義すると以下の通り。結果(+)結果(-)行周辺合計要因(+)ABA+B(=R1)要因(-)CDC+D(=R2)列周辺合計A...
研究デザイン 曝露(exposure)
定義曝露(exposure)とは要因のことである。具体的な意味は、治療を受けることであったり、リスク因子を持つことであったり、研究によって異なる。臨床疫学では要因あり群を曝露群、要因なし群を非曝露群と呼ぶ。
研究デザイン 観察研究
定義観察研究は介入を伴わない研究デザインの総称である。観察研究は更に、比較検討の有無により、比較を伴う分析的観察研究と、比較を伴わない記述的観察研究（記述研究）に分類される。関連診療実態研究 診療実態研究は記述研究の１種である。
研究デザイン 縦断研究(longitudinal study)
定義縦断研究とは、研究によって得られたデータが２つ以上の時点に関連している研究のことである。２時点以上の測定が必要な研究といってもよい。１時点の測定データのみを使用する横断研究(cross-sectional study)の対義語である。分...
研究デザイン 横断研究 (cross-sectional study)
定義横断研究(cross-sectional study)とは、研究によって得られたデータが全て同一時点の情報である研究のことである。曝露と疾病を同時に測定する研究である。横断研究のメリットとデメリットメリット横断研究では１時点の状態のみを...
研究デザイン 分析的研究
定義分析研究とは、研究内に複数の群があり、群間の比較を伴う研究である。通常、介入研究は分析研究でもある。観察研究には分析的観察研究(analytical observational study)と、記述研究(descriptive stud...
研究デザイン 介入研究
同義語実験研究定義研究者による被験者に対する何らかの介入を伴う研究のこと。対義語は観察研究（＝介入を伴わない研究）である。介入研究の目的は、介入群と非介入群で結果の差があるかどうかを比較することである。この、介入群と非介入群の割り付けが無作...
Simplicity Simplicity2でヘッダーの画像と文字が重ならないようにする方法
Simplicityはヘッダーの画像の上に、サイトのタイトルと説明文が表示されるようデザインされている。実際にやってみるとわかるが、この仕様だと写真の色と文字色が近い場合、文字がとても読みにくい。例えば以下の画像のようになる。この仕様だとヘ...
Simplicity Simplicity2でヘッダー画像の高さを設定する方法（注意点あり）
Simplicity 2ではカスタマイザからヘッダー画像を設定できる。Simplicityではヘッダー画像の高さはデフォルトで100ピクセルが推奨されている。このサイトのヘッダー画像はこのデフォルトの高さである。このままでいい場合もあるが、...
WordPress本体 WordPressのテーマを編集する方法（マルチサイトの場合）
WordPressではテーマファイルをWordPressの管理画面から編集することができる。この機能を使用すると、FTPを経由する手間を省くことができる。マルチサイトの場合、 → → → からこの機能を使用することができる。（子サイトからは...
本 独学者のためのRを学ぶ本
統計ソフトRを独学するための本を紹介します。Rの本は内容的には、入門書、リファレンス、各統計手法に特化した本などに分類できると思います。また統計学に重きをおいた本とプログラミングに重きをおいた本という分類もできると思います。入門書Rは統計解...
{base} [R] {base} library()とrequire() : パッケージを読み込む
説明base::library()とbase::require()は共に、Rのアドオン・パッケージを読み込む。パッケージを読み込むという点では両関数の機能は同じである。違いは、require()は他の関数の内部で使用する目的でデザインされて...
データマイニング辞典 交差妥当化 (cross validation)
定義交差妥当化(cross validation)とは、統計モデルが、そのモデルを構築する際に使用したデータ＝学習データ）とは別のデータセットに対してどの程度、一般化可能であるかを評価する手法である。要するに統計モデルの評価法の外的妥当性 ...
標本抽出法 層化多段抽出法(stratified multistage sampling)
定義層化多段抽出法 (stratified multistage sampling)とは層化抽出法 (stratified sampling)と多段抽出法 (multistage sampling)を併用する抽出法である。具体的には、まず全...