Dr.Clover’s Computer Clinic

[UTD] Treatment approach to metastatis hormone receptor-positive, HER2-negative breast cancer: Endocrine therapy

UpToDateまとめ：ホルモン陽性、HER2陰性の転移性乳癌に対する内分泌治療のアプローチ治療方針急速進行するあるいは臓器不全を伴う内臓に広範に広がる遠隔転移のある患者での第一選択は、ホルモン療法ではなく化学療法である。化学療法が奏功した...

2017.06.14

医学論文&UTD

[Death Education] 医療資源としての輪廻転生

竹倉史人は『輪廻転生　〈私〉をつなぐ生まれ変わりの物語 (講談社現代新書)』のなかで、生まれ変わりという観念を「医療資源」とみなし、その治療効果を質的、量的に分析する実証研究の例を紹介している。多くの研究結果が、輪廻転生の観念には、人生の意...

2017.06.08

死生心理学

[UTD] Systemic treatment for metastatic breast cancer : General principles

Systemic treatment for metastatic breast cancer : General principles◆転移性乳がんの全身治療：一般原則生命予後転移性乳がん患者のmOSは18-24ヵ月（範囲：数ヶ月~数年）...

2017.06.08

医学論文&UTD

乳がん Ki-67の問題点

がんサポートの記事より「Ki-67の測定値は施設によって、また病理医間で相当なばらつきのあることが知られています。Ki-67の重大な問題点はこの再現性のなさです。どこからが高値でどこからが低値なのかということが定まっておらず、抗がん薬治療を...

2017.06.07

医学備忘録

適性試験（自分の才能を知るための心理テスト）まとめ

適性試験とは就職活動などの際に適性検査を受けた経験のある方も多いだろう。適性とはいわば、もって生まれた才能、能力のことである。ある仕事をなすために必要な能力は様々ある。学習によって高められる能力もあるが、もって生まれたものと言うべきものもあ...

2017.06.03

心理検査

認知症のある高齢者のがんの確定診断をつける意義

認知症を患う高齢者が増えている。こうした方々は次第に自宅での生活が困難となり、施設で生活されている場合も多い。日頃こうした方々に対する訪問診療をさせて頂いているが、時にがんが強く疑われる場合がある。貧血の存在が疑うきっかけになることが多い。...

2017.06.02

クローバーの社

[論文] A Multicenter Study of Carbon Ion Radiotherapy for Head and Neck Adenocarcinoma.

原題Saitoh J, Koto M, Demizu Y, Suefuji H, Ohno T, Tsuji H, et al. A Multicenter Study of Carbon Ion Radiotherapy for Head...

2017.06.01

医学論文（抄読）

線量分布計算アルゴリズム

治療計算アルゴリズムは第４世代まであるようである参考九州大学の資料web.shs.kyushu-u.ac.jp/~arimura/1_DoseCalculationInRTP.pdf

2017.05.29

医学備忘録

癌のいろは（頭頸部がん）

病期分類 T2 は 2-4cmの大きさ(ににんがし) N2 は 3-6cm大きさ (にさんがろく) 頭頸部がんのStage N0ならT因子とStageが合致 N因子でStageが変わる N0-Ⅰ/Ⅱ N1-Ⅲ N2-IVA N3-IVb 最...

2017.05.29

医学備忘録

乳がんのサブタイプ

乳がんのサブタイプについて検索したところ、乳がんINFOナビという良いコンテンツを見つけたのでまとめた。乳がんのサブタイプ St. Gallen（ザンクトガレン）のコンセンサス会議で、乳がんは５つのサブタイプに分類されている。ホルモン受容...

2017.05.29

医学備忘録

咽頭収縮筋

咽頭収縮筋は上・中・下に分類される。特に上咽頭収縮筋への線量が55Gyを超えると嚥下障害の発生頻度が10Gyあたり19%上昇する。篠原2010 p.453

2017.05.29

医学備忘録

[UTD] 成人の原発性甲状腺機能低下症の治療

初期量成人のT4の平均完全置換用量は 1.6mcg/kg body weight/日である。（体重50kgで80mcg/日)。実際に加療に必要となる用量には、50~200mdg/日とばらつきがある。T4の必要量は全体重よりも除脂肪体重(le...

2017.05.24

医学論文&UTD

蕁麻疹の処方例

宮崎さんの処方歴から構成した。各ステップ１ヵ月程度で漸減していく。STEP1アレロックOD(5) 4T2Xザンタック(150) 2T2Xグリチロン 3T3Xトランサミン(250) 3Cp3Xプレドニン(5)1T1X 朝STEP2アレグラ(6...

2017.05.24

医学備忘録

一般線形モデルの検定

一般線形モデルの検定には主に以下２つがある。(1) パラメータの検定 (t検定)帰無仮説H0:母集団における説明変数のパラメータは０である。（要するにその説明変数は説明の役に全く立たない）以下の統計量が自由度n-kのt分布に従うことを利用し...

2017.05.23

一般線形モデル

ポワソン回帰分析(Poisson regression analysis)

同義語対数線形モデル(log linear model)定義ポワソン回帰分析(Poisson regression analysis)とは、応答変数にポワソン分布を仮定した一般線形モデルのことである。応答変数がカウントデータのような非負整数...

2017.05.23

ポワソン回帰分析

Null Deviance

定義null devianceとは、2 x (フルモデルの対数尤度 - 帰無モデルの対数尤度)である。要するにnull devianceは帰無モデルの残差逸脱度である。帰無モデルよりあてはまりの悪いモデルはない。フルモデルよりあてはまりのよ...

2017.05.23

モデル選択

平方和のタイプ

同義語残差平方和のタイプ定義平方和のタイプとは、統計モデルの残差平方和の計算方法の種類のことである。複数のモデルを比較するためには、各モデルの平方和を計算する必要がある。しかし平方和の定義は複数あるのである。タイプⅠ検定 (type Ⅰ t...

2017.05.18

分散分析

サンプルサイズ(sample size)

同義語標本の大きさ定義サンプルサイズ(sample size)とは標本(sample)に含まれる測定値の個数のことである。関連標本(sample)

2017.05.18

推定

統計量(statistics)

定義統計量(statistics)とは、分布の特徴を表す値のことである。代表値(representative value)と散布度(dispersion)が主なものである。関連統計量（記述統計の文脈では）代表値(representative...

2017.05.18

推定

標本統計量(sample statistics)

定義標本統計量(sample statistics)とは、標本の平均や分散など標本の分布の特徴を表す値（＝統計量）のことである。関連母数(parameter)

2017.05.18

推定

ダミーコーディング(dummy coding)

定義ダミーコーディング(dummy coding)とは、ダミー変数を使用して質的変数を表現する操作のことである。ダミーコーディングの目的は質的変数を統計モデルに含めることである。ダミーコーディングの例例として、A、B、Cという３つの水準のあ...

2017.05.18

分散分析

ダミー変数(dummy variable)

定義ダミー変数(dummy variable)とは、質的変数を統計モデルに投入するために使用する便宜的な変数のことである。質的変数はそのままでは統計モデルに投入することができない（投入できるのは量的変数のみである）。統計モデルで質的変数を使...

2017.05.18

分散分析

一般線形モデルの拡張

一般線形モデルは、(1)応答変数が正規分布に従うこと、(2)説明変数に変量効果が存在しないこと（＝全ての測定値が独立であること）の２つを仮定している。(1),(2)それぞれの仮定を外すことにより、一般線形モデルは以下のように拡張することが可...

2017.05.18

一般線形モデル

[論文] 米国膀胱温存治療の実態研究

原著Bladder-preserving Therapy Patterns of Care: A Survey of United States Radiation Oncologists Red 2017要約目的筋層浸潤膀胱癌(muscl...

2017.05.18

医学論文（抄読）

オッカムの剃刀(Occam’s razor)

同義語節約の原理定義（統計学における）オッカムの剃刀(Occam’s razor)とは、複数の予測力が同等のモデルが存在する場合、説明変数の数がより少ないものを優れているとみなすモデル選択の原則のことである。実際にオッカムの剃刀に基づくモデ...

2017.05.18

モデル選択

フルモデル(full model)

定義【用法１】ネストしたモデル(nested model)間のモデル選択の文脈においてフルモデルは最も多くの説明変数を含んだモデルのことである。【用法２】オーバーフィッティングの文脈においてフルモデル(full model)とは、測定の個数...

2017.05.18

モデル選択

クックの距離(Cook’s distance)

定義クックの距離(Cook's distance)とは、一般線形モデルにおいて各測定値がモデル推定に与える影響の大きさを表す数値のことである。クックの距離は以下の式で計算される。$${ d }_{ i }=\frac { 1 }{ k } ...

2017.05.17

一般線形モデル

標準化残差(standardized residual)

定義標準化残差(standardized residual)とは、一般線形モデルにおける残差を標準化したものである。標準化残差(ri)は以下の式で計算される。$${ r }_{ i }=\frac { { y }_{ i }-{ \hat ...

2017.05.17

一般線形モデル

テコ比(leverage)

定義テコ比とは、データの個々の測定値が、モデル（のパラメータ、ひいては予測値）に与えている影響の大きさを表す数値である。例えば一般的な傾向から大きくハズレたデータはそれ１つでモデルに大きな影響を及ぼすため大きなテコ比率を持つ。テコ比は以下の...

2017.05.17

一般線形モデル

予測値と残差のプロット

定義予測値と残差のプロットはy軸を残差、x軸を予測値とするグラフである。予測値と残差のプロットは、一般線形モデルのモデル診断に使用されるグラフの１つである。一般線形モデルの仮定（残差の独立・正規・等分散）が成立しているなら、予測値と残差の間...

2017.05.17

一般線形モデル

QQプロット

同義語Q-Qプロット、正規確率ブロット定義QQプロットはy軸を標準化残差(standardized residual)、x軸を理論的分位点(theoretical quantiles）とするグラフである。QQプロットは、一般線形モデルの「誤...

2017.05.17

一般線形モデル

最小二乗法(least square method)

定義最小二乗法(least square method)とは、統計モデルのパラメータ推定法の１つである。即ち統計モデルに基づく予測値と実測値の差が最小になるパラメータ値を計算し、これをパラメータの推定値とする方法である。一般線形モデルにおけ...

2017.05.17

一般線形モデル

投資を考える

株や不動産などの投資はバクチである、怖いという印象を持っている人も多いだろう。実際、雇われて給料をもらう労働と比べれば、投資は損をする可能性がある。怖いという印象には根拠がある。損をするかもしれないリスクは誰もが取れるわけではない。ある程度...

2017.05.17

クローバーの社

WordPressアドレスとサイトアドレスの違い

WordPressには、「WordPressアドレス」と「サイトアドレス」という２種類のアドレスがある。おそらくこの名前から両者の意味を推測出来る人は稀であろう。両者の別名と意味を下の表に整理した。名称別名意味WordPressアドレス(W...

2017.05.10

WordPress本体

感染呪術(contagious magic)

定義イギリスの人類学者ジェイムズ・フレイザーが提唱した呪術の概念である。彼は呪術を大きく模倣呪術と感染呪術に分類している。感染呪術とは、一度物理的に接触していたもの、あるいはかつて１つであったものは、その後離れてもそのことを記憶しており相互...

2017.05.09

雑学辞典

模倣呪術（類感呪術）

同義語類感呪術(sympathetic magic)、模倣呪術(Imitative magic)定義イギリスの人類学者ジェイムズ・フレイザーが提唱した呪術の概念である。彼は呪術を大きく類感呪術と感染呪術に分類している。類感呪術とは、類似の原...

2017.05.09

雑学辞典

独学者のための瞑想（マインドフルネス）を学ぶ本

ストレス社会を反映して瞑想（マインドフルネス）がブームである。マインドフルネスの原点にあるのは仏教の瞑想技術である。古代から仏教を受容してきた日本では、瞑想は主に禅を通して大昔から連綿と存在してきた。しかし今日ブームになっているのはこれでは...

2017.05.08

本

訪問診療における多剤内服（ポリファーマシー）を考える

訪問診療の初診時に心がけることの一つは内服薬の整理である。要するに前医で飲んでいた薬の数を減らすことである。高齢者は通院を重ねる内に次第に薬が増えていき、訪問診療に辿り着く頃にはかなりの数になっていることが多い。これは多剤併用(polyph...

2017.05.06

クローバーの社

central moment

定義central momemtとは以下の数式で定義される量${ \mu }_{ r }$である。$${ \mu }_{ r }^{ }=E{ (X-\mu ) }^{ r },\quad r=1,2,\dots $$Xは確率変数、${ \...

2017.05.06

離散分布

raw moment

定義raw momentとは確率変数Xのr乗(X^r)の期待値である。原点まわりのXのr次モーメントとも呼ぶ。$$ { M }_{ X }^{ (r) }(0)=E{ ({ X }^{ r }) }={ \mu }_{ r }^{ ' }...

2017.05.06

離散分布

モーメント母関数(moment generating function : MGF)

定義$$ { M }_{ X }(t)=E({ e }^{ tX })=\sum _{ x\in S }^{ }{ { e }^{ tx }{ f }_{ X }(x) } $$MGFはラプラス変換(Laplace Transform)とし...

2017.05.06

離散分布

二項分布（binominal distribution）

定義成功確率pのベルヌーイ試行をn回繰り返した時にx回成功する確率を表す分布表記$$X\quad \sim \quad binom(size=n,\quad prob=p)$$PMF$${ f }_{ X }(x)=\left( \begi...

2017.05.06

離散分布

一様分布（discrete uniform distribution）

定義整数1,2,...,mから1つの整数を選ぶ場合にある整数が選ばれる確率の分布表記$$X\quad \sim \quad disunif(m)$$PMF$$ { f }_{ X }(x)=\frac { 1 }{ m } ,\quad x...

2017.05.06

離散分布

独立な確率変数の計算法則

独立な確率変数について以下の命題が成立するE(u(X)v(Y)) = E(u(X)) E(v(Y))

2017.05.05

多変数分布

joint cumulative distribution function

joint cumulative distribution function とは確率変数X、Yに関して以下の式で定義される関数である。$${ F }_{ X,Y }(x,y)=P(X\le x,\quad Y\le y),\quad fo...

2017.05.05

多変数分布

独立な確率変数のモーメント母関数

定義独立な確率変数X、Yがある時、その合成変数X+Yのモーメント母関数は以下の式で与えられる。$${ M }_{ X+Y }(t)={ M }_{ x }(t)\cdot { M }_{ y }(t)$$参考Introduction to ...

2017.05.05

多変数分布

joint probability mass function

離散型の確率変数X、Yがあり、それぞれのサポートがSX、SY、PMFがfX、fXであるとする。すなわち以下の表の関係があるとする。確率変数サポートPMFXSXfXYSYfXこの時、joint probability mass functio...

2017.05.05

多変数分布

交換可能な確率変数(exchangeable random variables)

定義確率変数X、Yは、そのjoint CDFが引数に関してシンメトリック（対称的）な関数である場合、交換可能(exchangeable)と呼ばれる。{ F }_{ X,Y }(x,y)={ F }_{ X,Y }(y,x),\quad fo...

2017.05.05

多変数分布

副業を考える

本業がものすごく儲かっていて、かつものすごく忙しいのでない限り、誰しも副業を考えてみたらよいと思う。副業にはもちろん、収入を増やす、収入源を複数化するという経済的メリットがある。しかし副業のメリットは経済に限らない。副業をしようと思えば、何...

2017.05.03

クローバーの社

[R]base::diag() : 対角行列を生成あるいは行列の対角成分を取得/設定する関数

説明行列の対角成分を抽出あるいは設定する。あるいは対角行列を生成する。この関数には「詳細」の項で説明されているように４つの全く異なる用法がある。使用法diag(x = 1, nrow, ncol)diag(x) <- value引数x : ...

2017.05.02

{base}