{base}[R]base::diag() : 対角行列を生成あるいは行列の対角成分を取得/設定する関数
説明 行列の対角成分を抽出あるいは設定する。あるいは対角行列を生成する。 この関数には「詳細」の項で説明されているように４つの全く異なる用法がある。 使用法 diag(x = 1, nrow, ncol) diag(x) &l...
{base}医学論文&UTDDeath Anxiety, Locus of Control, and Purpose in Life of Physicians. Their Relationship to Patient Death Notification.
要約 Viswanathanは、155人の医師を対象としたアンケート調査を実施し、性別、専門分野により死の不安、コントロールの座、人生の目的意識に差があるかどうか、またこれらの変数が死の告知に関する態度に影響をおよぼすかどうかを検討した。...
Zotero[Zotero] ChromeからZoteroへ文献情報を直接取り込む方法（Zotero Connector：Chrome拡張）
Zoteroの強みの１つは、ブラウザで閲覧中の文書の書誌情報を簡単取り込めることである。 この機能を使えば、Webサイトはもちろん、Amazonで販売されている本、UpToDateの記事などの書誌情報も簡単に作成できる。PDFファイル...
医学備忘録メニエール病の薬物治療
参考
医学備忘録脳転移の保存治療（薬物治療）
処方例(My Recipe) 軽症の場合 リンデロン 2mg1x 朝 or リンデロン 1mg1x 朝 パリエット(10) 1T1X 朝 メニレットゼリー(30g製剤) 1日3個/分3 症状が強い場合は、ステロイド...
Windows10Windows10のイベントログの確認方法
サーバーが異常終了した場合など、Windowsのログを確認することで原因解明の手がかりが得られることがある。以下にWindows10でイベントログを確認する手順を示す。 (1) → → を起動 (2)イベントビューア...
3次予防(治療)胸腺腫瘍の分類
概要 胸腺腫瘍の分類として(1) WHO組織分類(WHO histologic grading system)、(2)正岡分類 (Masaoka staging sysmte)の２つが重要である。 (1) WHO組織分類(WHO his...
SimplicitySimplicityでフォローボタンが表示されない場合にチェックすべきこと
Simplicityのフォローボタンとは画面右上に表示されるこんな感じのボタンである。 いつもは表示されていたはずがふと気づくと表示されなくなっていた。 Simplicityではサイトのタイトルは左寄せがデフォルトなので...
Word[Word](2013)Excelから貼り付けた大きな図表をWordのページ幅におさめる方法
横長の表をWordに貼り付けようとすると、右側がページの外にはみ出してしまう（切れてしまう）ことがある。例えば下図のような感じである。 解決法 この問題を解决する方法はいくつか考えられる。 方法(1)表の左上のハンドルを右クリ...
医学備忘録乳癌脳転移の治療方針
乳癌脳転移の治療方針についてUpToDateのリコメンドを抄訳した。 Management of brain metastases in breast cancer 乳癌患者の脳転移の管理方針はまだ十分に確立していない。 ...
医学備忘録脳転移の予後
脳転移患者の生命予後予測ツールは複数開発されている。 RTOG RPA（脳転移患者の予後） Prognostic groups for outcome after palliative treatment of brain metast...
R言語[R] CRANextrasとは何か？
Rのリポジトリの１つに、CRAN (extras)というものがある。 これが何者なのか、Webではわかりやすい説明が見つけられなかったが、R FAQに以下の記述がある。 Some CRAN packages that do not ...
確率論サポート(support)
定義 確率論におけるサポート(support)とは、ある試行(trial)における実現値(realization)に値を割り当てたとして、それら割り当てられた値の集合のことである。
数学用語（補遺）関数の連続(continuous)、右連続(right-continuous)、左連続(left-continuous)
ある関数が以下の条件を満たす時、その関数はある点aで連続(continuous)であると呼ばれる。 $$\underset { x\rightarrow a }{ lim } f(x)=f(a)$$ ある関数が以下の条件...
連続分布分位点関数(quantile function)
同義語 percent-point function, inverse cumulative distribution function. 日本語の訳は定まっていないようである。分位関数、分位点関数、分位数関数などと翻訳可能と考えた...
離散分布empirical probability mass function (EPMF)
定義 empirical probability mass function (EPMF)とは、サポートx1,x2,...xnの各値に確率質量(probability mass) 1/nを割り当てる関数である。数式で書けば以下の通り。 ...
離散分布ポワソン分布(Poisson distribution)
定義 時間間隔に事象が起きる平均回数をλとする。当該時間間隔に事象が発生する回数Xをサポートとする分布である。 表記 X～pois(lambda=λ) PMF（確率質量関数） $${ f }_{ X }(x)=P(X=x)={...
離散分布負の二項分布(negative binominal distribution)
定義 ベルヌーイ試行を繰り返した際に、r回成功するまでに出現した失敗の回数をＸをサポートとする分布である。 別定義：ベルヌーイ試行を繰り返した際に、r回成功するまでに実施した全試行回数をYをサポートとする分布とする流儀もある。こ...
離散分布幾何分布(geometric distribution)
定義 幾何分布(geometric distribution)とは、ベルヌーイ試行を繰り返した際に、最初に成功するまでに出現した失敗の回数をＸをサポートとする分布である。 別定義：ベルヌーイ試行を繰り返した際に、最初に成功するま...
離散分布超幾何分布(hypergeometric distribution)
定義 例えば、白玉M個、黒玉N個を含む袋から"復元なし"でK個を抽出する場合に、白玉がx個である確率を表す分布である。 表記 X～hyper(m=M、n=N、k=K) PMF（確率質量関数） $${ f }_{ X }(x)=...
医学論文&UTDNeutrophil-To-Lymphocyte Ratio: An Emerging Marker Predicting Prognosis in Elderly Adults with Community-Acquired Pneumonia
原題： Neutrophil-To-Lymphocyte Ratio: An Emerging Marker Predicting Prognosis in Elderly Adults with Community-Acquired Pn...
Apache[Apache] インデックス一覧のファイル名の表示文字数を変更する方法(mod_autoindex)
Apacheではmod_autoindexを使用して、ディレクトリ内のファイル一覧を表示することができる。 日本語の長いファイル名のファイルが存在する場合、文字化けのような表示になる場合がある。例えば以下のような具合である。 ...
その他ウェブアプリ[FESS] ファイルサーバーの全文検索システムを作る方法
全文検索システムであるFESSを使用すれば、ファイルサーバーにWebインターフェースの全文検索機能を追加できる。PDFやMSオフィス文書を含む大量のファイルを全文検索できれば、蓄積してきたファイルの資産価値を爆発的に高めることができる。 ...
Windows10Windows10で環境変数を確認・設定する方法（OS標準機能とGUIソフトの紹介）
Windows10で環境変数を確認・設定するには(1)OSの標準機能を使用する方法、(2)サードパーティのソフトウェアを使用する方法、の２つがある。以下それぞれの方法を紹介する。 OSの標準機能を使用する方法 (1) Windowsボタ...
WordPressプラグインWP EncryptをWindowsサーバーで使用する方法
WP EncryptはLet's Encryptを使用可能にするWordPressのプラグインである。WP Encryptを使用すれば、これ以外のソフトを一切使用する必要なく、Windows(+Apache)環境であってもLet's Enc...
{prob}[R]{prob}union() : 部分集合の和を求める関数
説明 確率空間の部分集合の和集合(union)を計算する 使用法 union(x, y, ...) 引数 x, y : ベクトル、データフレームあるいは概念的にアイテムのシーケンスを含むpsオブジェクト。 詳細 データフレーム...
{base}[R]{base}all() : 論理積を求める関数
説明 論理値型のベクトルを引数に取り、その全て（の要素）がTRUEであるかどうかを判定する関数である。 使用法 all(..., na.rm = FALSE) 引数 ... : 論理型ベクトル。論理型以外の長さゼロのベクトルは...
R言語[R]%in% : ベクトル(y)の各要素がベクトル(x)に含まれるかどうかを判定する演算子
説明 %in%演算子は、2つのベクトルx,yに対して、y %in% xという形で使用する。その意味は、yの各要素について１つずつそれがxの要素でもあるかどうかを判定し、そうであればTRUE、違えばFALSEを返すことである。従って返り値は...
確率論事象(event)
定義 事象(event)とは、ランダム実験における結果の集合である。即ち標本空有の部分集合(subset)である。 事象A1,A2,A3...があり、どのペアに関してもAi ∩ Aj = Φである時、これらの事象は相互排他(mutu...
{prob}[R]{prob}urnsamples() : ツボから区別可能な物を標本抽出する実験に対応する標本空間を作成する関数
説明 urnsamples()は、ツボから区別可能な物（例えば色の違うボール）を標本抽出する実験に対応する標本空間を作成する関数である。 使用法 ## S3 method for class 'data.frame' urnsamp...
確率論標本抽出(sampling)
定義 標本抽出(sampling)とは母集団からいくつかの標本を選び出すことである。 標本抽出の分類(1)：復元抽出と非復元抽出 母集団から複数の標本を取り出す時、１つ標本を取り出しては母集団に戻し、次の１つの標本を取り出すことを繰り...
{prob}[R]{prob}tosscoin() : コイン投げに相当する標本空間を作成する関数
説明 繰り返しコインを投げる（結果は表"H"または裏"T"）に対する標本空間を生成する関数である。 使用法 tosscoin( times, makespace = FALSE ) 引数 times : コインを投げる回数 ...
確率論標本空間(sample space)
定義 標本空間(sample space)とはランダム実験(random experiment)Eにおいて起こりうる全ての結果の集合のことである。 標本空間 (sample space)とは試行(trial)の結果として起こりうる全...
確率論random experiment
定義 random experimentとは、事前に結果を予測することの出来ない実験のことである。 統計学においてはexperimentを、deterministic experiment（事前に確実に結果を予測できる実験）とran...
クローバーの社将棋に見る強くなるための心の持ち方~名人戦と電脳戦から
NHKのプロフェッショナル仕事の流儀という番組で「将棋棋士 羽生善治 vs 森内俊之」（2008年）という放送があった。この中で強い印象に残ったのは、途中１敗を喫した森内プロが敗戦のショックで数日盤面に向かえなかったというくだりである。これ...
{grDevices}[R]{grDevices}boxplot.stats() : 箱ひげ図生成に必要な諸統計量を出力する関数
説明 boxplot.stats()は箱ひげ図の生成に必要な諸統計量を計算する関数である。通常は箱ひげ図の描画の際に別の関数から呼び出されて使用されるが、この関数を単体で使用することも可能である。 使用法 boxplot.stats(...
記述統計(1変数)５要約統計量(five number summary)
同義語 Tukey's five number summary 定義 ５要約統計量(five number summary)とはあるデータセットの最小値(minimum)、下位ヒンジ(lower-hinge)、中央値(median...
{stats}[R]{stats}fivenum() : データセットの５要約統計量を出力する関数
説明 fivenum()は引数で渡されたデータセットの５要約統計量(Tukey's five number summary)を出力する関数である。 使用法 fivenum(x, na.rm = TRUE) 引数 x : 数値（欠損...
3次予防(治療)放射線治療と併用すべきではない薬剤
抗癌剤 アドリアマイシン ブレオマイシン(肺線維症) ゲムシタビン(本邦禁忌) 分子標的薬 イレッサ 本剤と他の抗悪性腫瘍剤や放射線治療との同時併用における有効性と安全性は証明されていないので、実地医療として...
医学備忘録放射線治療専門医受験記（放射線物理学まとめ）
放射線の単位 概念 単位 吸収線量(absorbed dose) = 等価線量 比放射能 [Bq/g 線エネルギー付与 吸収線量 : = ...
医学備忘録放射線治療専門医受験記（耐容線量まとめ）
皮膚 70Gy ? TD5/5(1/3) 全脳照射 50Gy TD5/5(2/3)が50Gy 腕神経叢 60Gy 視神経・視交叉 50Gy (体積効果なし) 心臓、食道 60Gy 小腸 50Gy
医学備忘録放射線治療専門医受験記（処方線量まとめ）
脳神経領域 脳腫瘍は良性 50Gy、悪性 60Gyとその間くらい。脳胚腫は40Gy程度。 髄膜腫は良性 54Gy、悪性 60Gy 髄芽腫(標準リスク、ケモ併用) CSI 23.4Gy + boost 54Gyまで ...
RStudioレボリューションRとマイクロソフトRサーバーとは？
レボルーションRは、米国の米Revolution Analytics社が開発した、既存のRの全スクリプトを実行可能なRとの互換性を保持しながら、パフォーマンス（メモリ制限の撤廃や処理の高速化など）を改善したRの商業的実装のことである。 ...
{base}[R]{base}sort() : １変数をソートする関数
説明 ベクトルあるいは因子を昇順または降順で並び替える。 １変数以上のもの（＝多変数）を並べ替えたい時（例えばデータフレームをソートしたい時など）にはorder()を使用する。 使用法 sort(x, decreasing = ...
記述統計(1変数)尖度(kurtosis)
定義 尖度(kurtosis)は分布の尖り具合の指標である。 平たい分布をplatykurtic、尖った分布をleptokurtic、両者の中間の分布をmesokurticと呼ぶ。 分類 例 platyku...
記述統計(1変数)歪度(skewness)
定義 歪度(skewness)は分布の非対称性の指標である。以下の式のg1で定義される。 $$ { g }_{ 1 }=\frac { 1 }{ n } \frac { \sum _{ i=1 }^{ n }{ { ({ ...
記述統計(1変数)順序統計(order statistic)
定義 順序統計(order statistic)とは、x1,x2,x3...,xnからなるデータセットがある時、データを昇順で並び替えて作った以下のものことである。 $$ { x }_{ (1) }\le { x }_{ (2)...
記述統計(1変数)CUSS (Center, Unusual features, spread, and shape)
定義 CUSS (Center, Unusual features, Spread, and Shape)とは、分布の特徴を表す４つの指標の略語(acronym)である。 Center（中心）：分布の中心を表す値。平均や中央値(me...
記述統計(1変数)データの型(types of data)
Kernsの分類 データの型の分類方法には様々なものがあるが、Kernsは以下の分類を提唱している。 量的(qualitative) 連続(continuous) 離散(discrete) 質的(quantitative) ...
{aplpack}[R]{aplpack}stem.leaf() : 幹葉図を描画する関数
説明 古典的（"Tukey-style")な幹葉図を描画する。 使用法 stem.leaf(data, unit, m, Min, Max, rule.line = c("Dixon", "Velleman", "Sturges"),...