数学用語（補遺） ベクトル(vector)
定義ベクトルとは向きと大きさを持つ量である。ベクトルの表記法(1) 文字の上に→をつける。$$ \overrightarrow { A } $$(2) ベクトルの成分表示$$ \overrightarrow { OA } =(2,1)$...
数学用語（補遺） 漢方薬辞典 腎虚（じんきょ）
定義腎虚とは、生まれた時に両親から受け継いだ生命エネルギーである「先天の気（＝腎気）」が枯渇した状態である。平たく言えば老化（エイジング）のことと考えられる。具体的な腎虚の賞状として、下半身の冷えや脱力、かすみ目、脱毛などが挙げられている。...
漢方薬辞典 補腎剤（ほじんざい）
定義補腎剤（ほじんざい）とは漢方医学で「腎虚」と呼ばれる状態を改善するための漢方薬の一群である。牛車腎気丸、八味地黄丸などがある。関連腎虚
漢方薬辞典 病名漢方
定義病名漢方とは、西洋医が西洋医学の病名（診断）に基づき、その診断に対する治療薬として漢方薬を使用する漢方医学の使い方のことである。本来の漢方においては、漢方医学の診断に基づき、使用する漢方薬を決定する。病名漢方は漢方医の立場からは不十分と...
漢方薬辞典 補剤（ほざい）
同義語参耆剤（じんぎざい）：人参と黄耆を主成分とする薬剤の意味。補剤はまさにそうであることからこの別名がある。定義補剤とは、気力・体力の低下した患者を元気にする目的で使用される漢方薬の一群の総称である。補剤の処方構成４生薬（人参・黄耆・当帰...
医学辞典 骨密度(bone mineral density ; BMD)
定義骨密度(bone mineral density ; BMD) = 骨塩量(bone mineral content ; BMC) ÷ 骨面積なお、骨塩量(bone mineral content)とはX線を用いた画像検査のROIに沈着...
ベイス統計 Bayesian p-value
定義Bayesian p-valueとは、ベイス統計によって推定された回帰係数のパラメータが０より大きい（または小さい）確率のことである。パラメータが０より大きい（または小さい）ことはパラメータが有意であること意味する。伝統的な統計学では回...
重回帰分析 重回帰(multiple linear regression)
定義重回帰(multiple linear regression)とは、説明変数が２つ以上ある回帰のことである。モデル式は以下の通り。y = β0 + ΣβiXi + ε(y:目的変数、Xi:説明変数、βi:回帰係数、ε:ノイズ)β0は回帰...
単回帰分析 単回帰(simple linear regression)
定義単回帰(simple linear regression)とは、説明変数が１つの回帰のことである。モデル式では以下のように記述される。y = β0 + β1x + ε(y:目的変数、x:説明変数、ε:ノイズ)関連重回帰目的変数(obje...
医学論文（抄読） [論文]緩和目的の低線量全肝照射(WLRT)
出典Høyer M, Swaminath A, Bydder S, Lock M, Méndez Romero A, Kavanagh B, et al. Radiotherapy for Liver Metastases: A Revie...
{base} [R]base::apply() : 配列の周辺に関数を適用する関数
説明配列あるいは行列の周辺に関数を適用し結果として得られた値をベクトル、配列、あるいはリストとして返す。使用法apply(X, MARGIN, FUN, ...)引数X 配列あるいは行列MARGIN 関数を適用する要素の添字を与えるベクトル...
{stats} [R]stats::quantile() : 標本の分位点を求める関数
概要quantile()は引数で指定された分位点（0~1の確率で指定する）に対応する標本分位点(sample quantiles)を返すジェネリック関数である。観察された最小値は確率0に、 最大値は確率1に対応する。使用法quantile(...
ベイス統計 MAP推定値(maximum a posteriori estimate)
同義語事後確率最大推定値(maximum a posteriori estimate)、MAP推定値(MAP estimate)定義MAP推定値とは、事後分布p(θ|Y)の値が最大となる点θ*のことである。参考StanとRでベイズ統計モデリ...
その他ウェブアプリ PDFの全文検索システムを構築する方法
PDF全文検索システムを構築する理由PDFに限らずOfficeファイルなど蓄積した文書を一括検索したいのは、情報の利用価値を高めるため当然の要望である。特にPDFの全文検索システムが必要な個人的理由としては以下２つがある。 自炊したPDFを...
Simplicity [Simplicity] 記事の見た目をカスタマイズする方法（CSSの編集方法）
Simplicityで記事の見た目をカスタマイズするには、子テーマの中の２つのCSSファイルを修正すればよい。 style.css editor-style.css訪問者に表示される記事の外観をカスタマイズするのが「style.css」であ...
その他アプリ [Chrome] ３種類の再読み込みの違いを理解する（キャッシュを完全にクリアするために）
Chromeにはページを再読み込する方法が３つある。いずれもページを更新するのは同じであるが、キャッシュの扱いが異なる。即ち、全然削除しない（＝再読込しない）、一部削除する（＝一部再読込する）、全部削除する（＝全部再読込する）という３段階が...
因果関係 逆問題(inverse problem)
定義逆問題(inverse problem)とは、中身が不明のメカニズムに対して、インプットとアウトプットの一部のみがわかっている条件で、メカニズムの中身を推定しようとする問題である。逆問題の多くは答えを何通りも考えることができ答えが一意に...
ベイス統計 MCMC(Markov Chain Monte Carlo methods)
定義MCMCとは、ベイズ統計モデリングにおける事後確率（パラメータの確率分布）を推定する方法（アイディア）である。具体的には、事後分布p(θ|Y)に比例する分布であるp(Y|θ)p(θ)から乱数サンプルを多数発生させて事後分布の代わりとする...
確率論 周辺化(marginalization)
定義周辺化(marginalization)とは、同時分布を構成する任意の変数について、その変数の取りうる全ての値に対応する確率を合算（離散型確率変数なら和をとる、連続型確率変数なら積分を実行する）する作業である。周辺化することにより全ての...
確率論 正規化
定義正規化とは、ある関数の和（離散変数の場合）や積分（連続変数の場合）が１になるように、その関数に定数を掛ける（または定数で割る）操作のことである。正規化は、ある関数が確率分布の条件（＝全事象の確率の和が１）を満たすようにするための操作であ...
確率論 確率密度関数(probability density function ; PDF)
同義語密度関数、密度定義確率密度関数(probability density function ; PDF)とは、連続型確率変数の確率分布を与える関数のことである。PDFは連続型確率変数に対して定義される。離散型確率変数でPDFに相当するも...
{graphics} [R]{graphics} boxplot() : 箱ひげ図を描画する関数
説明与えられた（グループ化された）データから、箱ひげ図（box-and-whisker plot(s)）を作成する。使用法# 基本構文boxplot(x, ...)# S3 method for class 'formula':boxplo...
逆引き辞典（機能別索引） [R][逆引き] 記述統計（要約統計）
要約統計量を計算stats::quantile() : 標本の分位点を求める関数meansdmaxminstats::fivenum() : データセットの５要約統計量を出力する関数全体要約関数（データ全体を要約）base::summary...
プロジェクト（乳癌） [論文] Annual Hazard Rates of Recurrence for Breast Cancer After Primary Therapy. 乳癌再発年間ハザード経時変化
原題Annual Hazard Rates of Recurrence for Breast Cancer After Primary Therapy目的乳がんの長期再発率は一定か、緩徐に低下か、ゼロに達するのかを決定すること。再発ハザード...
MySQL [MariaDB] データベースへの接続
現在のユーザーで接続可能なデータベース一覧の表示show databases;指定したデータベースへの接続use 接続したいデータベース名;別のデータベースに接続したい場合は、単にuseコマンドを再発行すればよい。現在接続中のデータベース名...
MySQL [MariaDB] ユーザー管理コマンド（閲覧、作成、権限付与、削除）
MariaDBでユーザーの管理に頻用するコマンドをまとめる。MariaDBではユーザーは単にユーザー名のみではなく、ユーザー名＋ホスト名(or IPアドレス)の組み合わせで管理されることに注意が必要である。ユーザー一覧の取得select U...
MySQL [Xampp][MariaDB] ログインとログアウトの方法
Xampp (on Windows)のMySQL/MariaDBにコマンドラインでの操作を行うためにはまずMySQL/MariaDBへのログインとログアウト方法をマスターする必要がある。（なおXamppの古いバージョンのデータベースがMyS...
WordPressプラグイン WP EncryptでSSLの自動更新に失敗する原因と対策
WordpressのプラグインWP Encryptは無料SSLであるLet's Encryptを使用してサイトをSSL化できる優れものである。Let’s Encryptの無料SSLの有効期間は３ヶ月なので、３ヶ月毎に更新が必要となる。WP ...
3次予防(治療) 乳がん治療と乳房再建術
乳がん治療の柱は、手術、薬物、放射線である。これらの抗腫瘍治療と乳房再建術の関係についてポイントを整理する。乳房切除術との兼ね合い２次再建の場合、乳癌手術後半年から１年おいてが理想的とされている。乳房再建術後６ヶ月程度たてば、乳頭・乳輪の再...
プロジェクト（乳癌） [論文] Breast Cancer Follow-Up and Management After Primary Treatment: American Society of Clinical Oncology Clinical Practice Guideline Update. 根治治療後の乳癌フォローアップおよび管理に関するガイドライン（ASCO）
歴史1997初版、1999,2006,2012に見直し。2006 → 2012では内容に変更なし。ガイドライン要約定期的な病歴、理学検査、マンモグラフィーが乳癌フォローアップで推奨される。理学検査は最初の3年は3-6ヶ月ごと、4-5年目は6...
確率論 期待値演算子(expectation operator)の計算規則（公式集）
期待値演算子に関して以下の計算規則が知られている。g,hを任意の関数、Xを確率変数、cを定数とする。E(c) = cE=c E g(X)E=Eg(X) + Eh(X)
プロジェクト（乳癌） 日本人女性の乳癌罹患率、乳癌死亡率、予後
『乳癌診療ガイドライン』総論１，総論２より抜粋死亡率1960年以降、粗死亡率、年齢調整死亡率ともに一貫して増加傾向である。乳癌死亡者数は13,148人(2013年)粗死亡率：人口 10万人対20.4人(2013年)粗死亡率の順位：大腸、肺、...
プロジェクト（乳癌） [UTD] Patterns of relapse and long-term complications of therapy in breast cancer survivors
導入"Breast cancer is the most frequently diagnosed cancer and the leading cause of cancer death in females worldwide."世界全...
疫学指標(疾病発生) 粗罹患率
定義粗罹患率 = 一定期間に新規発生した患者数（人） ÷ 危険曝露人口の観察期間の総和（人年）当該期間に危険曝露人口の脱落をほとんど無視できる場合、以下の定義も可能である。粗罹患率 = 一定期間に新規発生した患者数（人） ÷ 当該期間の人口...
疫学指標(疾病発生) 死亡率(mortality rate)
定義死亡率(mortality rate)とは、粗死亡率(crude mortality rate; CMR)と年齢調整死亡率(age-adjusted mortality rate)の総称である。関連粗死亡率(crude mortalit...
疫学指標(疾病発生) 粗死亡率(crude mortality rate; CMR)
定義粗死亡率(crude mortality rate; CMR)とは、一定期間の死亡数を単純にその期間の人口で割った値である。例えば１年間に人口10万人のうち何人死亡したか、という形で表現される。関連年齢調整死亡率(age-adjuste...
分散分析 特性値
定義特性値とは、分散分析において、一般の回帰モデルにおける目的変数(objective variable; 従属変数)に相当する概念である。概念的に同じであるが、分散分析には独特の言い回しが存在するということである。なお分散分析では、一般の...
医学備忘録 乳癌 – 放射線治療計画ガイドライン2016
全乳房照射の適応乳房温存術後患者は原則として全例が適応例外：70歳以上＆ホルモン感受性＆T1N0M0＆標準内分泌療法実施例 → 照射省略可能寡分割照射の適応(ASTROの症例選択ガイドライン）1) 50歳以上2) Stage pT1-2pN...
医学論文&UTD [UTD] Calcium and vitamin D supplementation in osteoporosis
骨粗鬆症におけるカルシウムおよびビタミンD補充療法至適摂取量経口至適摂取量は不明。著者は以下をオススメ。閉経後女性にはCa 1200mg/日 + Vit.D 800IU/日閉経前女性あるいは骨粗鬆症を伴う男性Ca 1000mg/日 + Vi...
雑学辞典 自由７科
定義自由７科とは、ローマ時代に整理されたリベラル・アーツの７科目のこと。すなわち、文法、修辞学、論理学、算術、幾何、天文学、音楽の７科目である。参考池上彰の18歳からの教養講座 ―現代世界を知るために (日経ビジネス人文庫)
医学論文&UTD [UTD] Osteoclast inhibitors for patients with bone metastases from breast, prostate, and other solid tumors
遠隔骨転移を伴う乳腺、前立腺およびその他の固形がん患者に対する破骨細胞阻害薬原題(UpToDate)Osteoclast inhibitors for patients with bone metastases from breast, p...
クラウド [Evernote] 複数クライアントを使い分ける方法
仕事用とプライベート用などで、Evernoteの複数アカウントを使い分けられたら便利だと思っている人もいるだろう。私は他の人との共有を想定としたアカウントと、自分専用のライフログ用のアカウントを使い分けている。Evernoteのアカウントを...
医学論文（抄読） [論文]局所進行食道がん患者に対する食道ステントの有無による毒性と臨床成績
原題Toxicity and Outcomes in Patients with and without Esophageal Stents in Locally Advanced Esophagus Cancer要約目的局所進行食道がん患...
本 一般の方が医学を知りたい時にお勧めの方法
筆者は現役の医師である。本記事では、医学を専門としない方々が、臨床医学を知りたいと思われた時によいと思われる方法を考えてみたい。医学はとにかく膨大な分野であるため、本当に効率の高いアドバイスをするためには何を知りたいのかを具体的にお聞きする...
{graphics} [R]{graphics}frame() : 新しいプロット・フレームを作成／開始する関数
説明frame()関数は現在のプロットを完了させ、新しい描画フレームを開始する。frame()はplot.new()関数の別名である。本関数は全ての高レベル描画関数で使用されており、複数図の領域が使用されている場合にそれをスキップする役に立...
クローバーの社 スマホやタブレットの充電ケーブルをすっきり整理する方法
スマホ、タブレットを複数持ちしている人は多い。そうなると日々の充電スペースをいかに美しく保つかという問題がでてくる。スパゲッティ状態も少なくないだろう。この問題を解決する製品は「充電ステーション」と呼ばれることが多い。試しに「充電ステーショ...
iPhone iTuneアフィリエイトの自動リンク(Auto Link Maker)の使用方法
前提作業この記事はiTunseアフィリエイトのアカウントを開設済であることを前提にしています。まだな人は以下の記事を参照にまずアカウントを開設して下さい。作業手順まずはアカウントにログインをします。すると画面のトップは以下のようになっていま...
iPhone iTunesでアフィリエイトを収益化する方法
iTunesの商品（Apple Music、iTunes Music、MacやiOSのアプリ、映画、テレビ、iBooks)はiTunesアフィリエイトプログラムを利用することで収益化の対象にすることができる。ちなみにiphoneやMac b...
クラウド [Evernote] １日１ノートでライフログ日記を残すためのアプリ（iOS編）
Evernoteをライフログ（日記）として使う場合、１日分の投稿が１ノートにまとまると便利である。残念ながらEvernote本体にはその機能はない。あくまで１投稿１ノートである。またカレンダー表示もない。これらの点はもう数年前から改善の要望...
死生心理学 Death Anxiety Scale (DAS) 日本語版
DASはTempler(1970)が開発した死の不安を測定する心理尺度である。15項目からなりYes/Noで回答する。以下に日本語版を示す。参考文献1. 木村正治, 広海義介. 大学生の死の不安に影響を及ぼす因子について:「死の教育」 のた...