研究デザイン 原集団(source population)
定義原集団(source population)とは、実施されたある研究の標本(study subjects, study sample)を抽出する元となったと考えられる集団のことである。実際の研究における原集団が何であるのかは、考えてみる...
研究デザイン 研究デザイン 時間ループ(time loop)
定義時間ループ(time loop)とは、研究（追跡）開始時点では入手不可能であり、追跡中に入手可能になるデータを使って、研究開始時点でのコホートの割当を変更することである。コホート研究におけるルール違反である。例えば、喫煙と発がんの因果関...
因果関係 潜伏期間(latent period)
定義潜伏期間(latent period)とは、疾病に罹患した時点から、実際にその疾病と診断されるまでに経過した時間のことである。疾病罹患時点は推定する他ないため、潜伏期間も推定値である。関連誘導時間(induction period)
研究デザイン コホート(cohort)
定義コホートとは「ある期間にわたり追跡される、特定の目的のために選ばれた個人の集まり」である(A Dictionary of Epidemiology)。コホートのメンバーはリスク集団 (population at risk)でもある。リス...
疫学指標(因果的効果) 総寄与分画
定義総寄与分画 = Σ(AFi x Pi)AFi : 曝露レベル i の寄与分画Pi : 全症例に対する曝露レベル i に分類される症例の割合総寄与分画は、集団全体に対する寄与分画である。曝露レベルが複数ある場合の、各曝露群の寄与分画の重み...
医学論文&UTD 周術期放射線治療が長期的な直腸肛門機能に与える影響
目的 直腸がんに対する周術期RTが局所制御を改善することは知られているが、直腸肛門機能に対する長期的な影響に対する報告は乏しい 本研究の目的は、短期間・高線量(5Gy x 5Fr)の直腸がんに対する周術期RTの長期的な直腸肛門機能に対する影...
3次予防(治療) anterior resection syndrome
定義anterior resection syndromeとは、直腸・肛門がんに対する低位前方切除術(low anterior resection : LAR)後に起きる、排便回数増加、便が房状になること(clustering)、便失禁、便...
クローバーの社 楽しいスロージョギングのためのランニングウォッチ情報[2016年]
ランニングウォッチとはランニングウォッチとは、心拍数計測機能、GPS機能、ログ機能、体力測定機能など、ランニングのための機能が追加された腕時計のことである。よいランニングウォッチがあるとスロージョギングが楽しくなる。ランニングウォッチには様...
その他アプリ [CatMemoNote] Dropboxで運用する際の問題点
CatMemoNoteとはCatMemoNoteはメモを記録するWindowsアプリ（フリーウェア）である。こちらで公開されている。CatMemoNoteにできること階層型でのメモ管理（実用上、階層数に制限はないと考えてよさそう）メモにパス...
疫学指標(因果的効果) 発生率比
同義語瞬時リスク比(instantaneous risk ratio)定義発生率比 = 曝露群の発生率 / 非曝露群の発生率瞬時のリスク比（観察時間が0に近い場合のリスク比）は発生率比と近似することから、瞬時リスク比の別名がある。
疫学指標(因果的効果) 寄与分画(attributable fraction)
同義語寄与分画(attributable fraction)寄与リスクパーセント(attributable risk percent)、寄与リスク(attributable risk)は古い用語である。定義寄与分画 = RD / R1 = ...
層別解析 標準化死亡比(standardized mortality ratio ; SMR)
定義標準化死亡比( standardized mortality ratio) = 観察された死亡数 / 期待死亡数標準化罹病比( standardized morbidity ratio) = 観察された罹病数 / 期待罹病数間接標準化法...
層別解析 粗率
定義粗率とは、層別化データの区分別の率を、その集団の実際の分布を重みとして加重平均したものである。層別化データの区分別の率を、別の集団の分布を重みとして加重平均したものが標準化率である。このことから、標準化率は「仮想の粗率」と呼ばれることが...
層別解析 標準化
定義標準化とは、層化データにおける層別の情報を単一の要約値へまとめる手法である。実質的には、層別の率の加重平均である。この加重平均を計算する際の重みに「基準(standard)」の人口あるいはその分布を使用するところがポイントである。関連標...
層別解析 残差交絡(residual confounding)
定義残差交絡(residual confounding)とは、層内の交絡のことである。層別解析は層間の交絡は制御するが、層内の交絡は制御しない。ここから層別解析によって制御される交絡の残差＝層内交絡という用語が生まれる。
層別解析 プール化(pooling)
定義プール化(pooling)は、層化データの情報を統合する手法の１つである。プール化リスク差/比（＠コホート研究）曝露非曝露合計症例aibiM1i非症例cidiM0iリスク人口合計N1iN0iTi上記のデータに対するプール化されたリスク差...
研究デザイン マッチング比(matching ratio)
定義マッチング比(matching ratio)とは、曝露群 : 非曝露群のマッチングの比のことである。マッチング比には(1)固定マッチング比、(2)可変マッチング比(variable matching ratio)の２つがある。固定マッチ...
一般線形モデル 交絡要約スコア(confounder summary score)
定義交絡要約スコア(confounder summary score)とは、複数の交絡因子の情報を要約した１つのスコア（要するに１つの合成変数）のことである。交絡要約スコアを使用するメリット交絡要約スコアのメリットは２つある。(1) データ...
一般線形モデル 因子化(factoring)
定義因子化(factoring)とは、連続変数を複数の範囲に区切った複数の因子からなる変数に変換することである。例えば年齢であれば、10歳ごとに区切り、10代、20代、30代...とするような操作である。
モデル選択 オーバーフィッティング(overfitting)
同義語過学習定義統計モデルのあてはめ(fitting)においては説明変数の数を増やせば増やすほど、モデルのあてはまりがよくなるという性質がある。しかし説明変数の数が多すぎるとそのモデルは将来の予測には役立たないものとなる。オーバーフィッティ...
モデル選択 ステップワイズ法
定義ステップワイズ法は、多変量回帰分析において、最終モデルに投入する予測変数を自動選択するアルゴリズムである。ステップワイズモデルは、因果モデルよりも、予測モデルを構築する際に意義があると考えられている。
重回帰分析 層別解析と多変量回帰分析の使い分け
ロスマンによれば、疫学における主要な分析方法は層別解析であり、多変量解析は補助的手段である。層別解析では扱えないほど交絡因子が多い場合、多変量解析はよい道具である。しかし交絡因子だと思ったものが実際に重要な交絡因子であるかどうかは、実際のデ...
一般線形モデル 変数変換
定義統計学における変数変換は、モデルフィッティングによって得らえるパラメータの推定値が、実際のデータの意味に照らして意味のある範囲内に収まるように制約をかけるために行う、変数の変換処理のことである。変数変換の例例１.対数変換従属変数が負の数...
医学辞典 MedLinePlus
定義MedLinePlusは、米国立医学図書館(National Library of Medicine, NLM)が運営する信頼できる医学情報のポータルサイトである。提供される主な情報は以下の通り。 975を超えるトピックに対する信頼でき...
医学辞典 PubMed
PubMedは、米国立生物工学情報センター(National Center for Biotechnology Information, NCBI)が提供する医学・生物学分野の文献検索サービスである。運営組織は以下の順で上部 → 下部組織と...
3次予防(治療) 抗がん剤の視神経毒性
視神経毒性の報告されている抗がん剤ビンクリスチン(vincrinstine)ニトロソウレア(nitrosoureas)シスプラチン(cisplatin)5-FU(5-fluorouracil)髄注メトトレキセート(methotrexate)...
3次予防(治療) 放射線視神経障害(radiation-induced optic neuropathy : RION)
定義放射線視神経障害(radiation-induced optic neuropathy : RION)とは、放射線照射の有害事象として発生する視神経障害である。発生機序は視神経乳頭(optic nerve head)と視神経の網板板後部...
{survival} [R] 生存曲線のX軸（時間軸）の尺度を週、月、年単位などに変更する方法
背景のsurvival::plot.survfit()関数を使用して生存曲線を描画すると、デフォルトではX軸（時間軸）の単位はデータベースの単位となる。例えば日単位でデータベースを作っていれば、カプランマイヤー曲線のX軸も日単位ということで...
疫学指標(因果的効果) 発生率差(incidence rate difference : IRD)
定義発生率差(incidence rate difference : IRD) = 曝露群の発生率(I1) - 非曝露群の発生率(I0)関連リスク差(risk difference : RD)
疫学指標(因果的効果) 混乱を招きやすい疫学用語まとめ
疫学指標には独特の難しさがある。原因1.日常用語と乖離した独特の言い回し原因2.疫学用語自体の中にある曖昧さや重複原因１への対処独特でわかりにくい用語を以下のように言い換える（頭の中で変換して考える）ことを推奨する。曝露＝原因疾病＝結果有病...
疫学指標(因果的効果) 相対的効果
定義相対的効果 = リスク差 / 非曝露群のリスク = RD / R0 = (R1-R0) / R0 = RR - 1R1:曝露群のリスクR0:非曝露群のリスクRR: リスク比(R1/R0)関連リスク差(risk difference)リス...
疫学指標(因果的効果) リスク差(risk difference : RD)
同義語リスク差(risk difference)、寄与リスク(attributable risk)定義リスク差＝曝露群のリスク(R1) - 非暴露群のリスク(R0)
疫学指標(因果的効果) 寄与率(attributable rate)
定義寄与率(attributable rate)とは、発生率差(incidence rate difference : IRD)を意味する古い疫学用語である。関連寄与リスク(attributable risk)
疫学指標(因果的効果) 寄与リスク(attributable risk)
定義寄与リスク(attributable risk)とは、リスク差(risk difference)を意味する古い疫学用語である。関連リスク差寄与率(attributable rate)
因果関係 反事実的理想(counterfactual ideal)
定義反事実的理想(counterfactual ideal)とは、因果関係を測定するために最も理想的であるが、実際には存在し得ない（＝反事実的な）、測定条件のことである。その意味するところは、ある曝露を受けた人を、曝露を受けないその人自身と...
感染症疫学 伝播流行(propagated epidemic)
定義伝播流行(propagated epidemic)とは、集団中で人から人へと伝染的・連鎖的に発生する流行のことである。インフルエンザの流行は伝播流行の例である。伝播流行における発生率の経時的変化伝播流行の発生率の経時的変化（流行曲線）は...
感染症疫学 点源流行(point-source epidemic)
定義点源流行(point-source epidemic)とは、原因物質に対する唯一の源（＝点源）への曝露から生じたと考えられる流行(epidemic)のことである。ある店である一時点に出された食事から発生した食中毒はこの例である。点源流行...
感染症疫学 集団発生(outbreak)
定義集団発生(outbreak)とは、通常全く、あるいはほどんど発生しない疾病の発生が突然増加することである。流行(epidemic)の１種である。関連流行(epidemic)
感染症疫学 流行(epidemic)
定義流行(epidemic)とは、疾病が通常状態と比較して、異常な高頻度で発生することである。通常状態の発生頻度とどの程度の乖離があれば、流行とするのが明確な定義があるわけではない。分類感染源が物理的なある１点のみで、人から人への二次的な伝...
3次予防(治療) 化学放射線治療の効果の組織学的判定基準（グレーディング）
がんの化学放射線治療の効果を組織学的に判定する場合に以下の基準が使用されることがある。出典Shiga, K., Yokoyama, J., Hashimoto, S., Saijo, S., Tateda, M., Ogawa, T., …...
疫学指標(疾病発生) リスクと発生率の関係
リスクと発生率の間には、以下の近似式がある。リスク≒発生率×時間この近似式は、計算された左辺のリスクが20%であればうまく使用できることが知られている。関連リスク(risk)発生率 (incidence rate)
疫学指標(疾病発生) 平均余命(expectation of life)
同義語平均余命(expectation of life)、期待生存時間(expected survival time)定義平均余命(expectation of life)とは、死亡するまでの平均時間である。発生率が経時的に変化しない定常状...
疫学指標(疾病発生) 待機時間(waiting time)
定義待機時間(waiting time)とは、事象が発生するまでの平均時間のことである。発生率が経時的に変化しない定常状態では、待機時間＝１／発生率という関係がある。
疫学指標(疾病発生) 年間発生率(annual incidence)
定義年間発生率(annual incidence)とは、「〇〇人年あたり××人」という形で表現された発生率のことである。疫学では１０万人あたりで報告することが多い。関連発生率 (incidence rate)
疫学指標(疾病発生) 症例致命率(case fatality rate)
定義症例致命率(case fatality rate)とは、既にある疾患を発症している人の中で、その疾患によって死亡する人の割合を示すリスク（発生割合）のことである。症例致命率は、実質的にリスクそのものであるにも関わらず、リスクの定義・解釈...
疫学指標(疾病発生) 死亡率(mortality rate)
定義死亡率(mortality rate)とは、測定事象が死亡である場合の発生率 (incidence rate)のことである。
疫学指標(疾病発生) 疾病リスク時間(time at risk of disease)
同義語疾病リスク時間、リスク時間定義疾病リスク時間とは、縦断研究(longitudinal study)中に、追跡された人々（リスク集団 (population at risk)が経験した時間の合計値のことである。疾病リスク時間は発生率 (...
感染症疫学 二次発病率(secondary attack rate)
定義二次発病率とは、感染症疫学において、感受性のある人が、初発患者（primary case：流行の最初に感染した症例）と直接接触して発症するリスク（発生割合）のことである。関連発病率(attack rate)
感染症疫学 発病率(attack rate)
定義発病率(attack rate)とは、流行期間中に感染症に罹患した人のリスク（発生割合）を示す感染症疫学の指標である。内容的にはリスクそのものであるが、リスクの報告・解釈に必須である時間単位が通常明示されない。時間単位は、感染症事態の生...
研究デザイン フィールド研究(field trial)
定義フィールド研究(field trial)は、疾病の１次予防を目的とした疫学的実験の１種である。疾病の治療を目的とした臨床研究では対象が患者であるのに対し、フィールド研究では対象が患者ではないという点が主な違いである。