メタアナリシスにおいて1次研究間の異質性が存在すると考えられる時には、変量効果モデルをあてはめて効果サイズの「統合推計値」を計算することが可能である。
しかしながら1次研究間の異質性が存在するということは、そもそも個々の研究ごとに異なる複数の「真の値」が存在することを仮定することと同義であり、この想定下において「統合推計値」そのものは意味をなさない(=解釈困難である)。
では何のためにこの「統合推計値」を計算するのか、という疑問がわくが、それは1次研究間の結果の差異を生み出す要因を特定し、各要因が結果に対して持つ効果量を測定するためである。
即ちこの「統合推計値」を目的変数とし、1次研究間の「真の値」の差異を生み出していると考える要因を説明変数として回帰分析を行うことで、各説明変数の有意性の検定と効果量の算出が可能となる。この回帰分析を「メタ回帰分析」と呼ぶ。
メタ回帰分析はマルチレベル分析の応用例の1つである。
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