{survival} [R]{survival}cluster() : 生存時間分析のモデル式の右辺の中でクラスター(相互関連する観察データのグループ)を指定する関数 説明cluster()は生存時間分析の文脈で、モデル式の右辺の中でクラスター(=相互関連する観察データのグループ)を指定する関数である。モデル式中でcluster()を使用することは、頑健サンドイッチ分散推定(robust sandwich... 2017.03.30 {survival}
{survival} [R]{survival}tmerge() : time varying covariateを含むデータセットを作る関数 説明tmerge()はtime-dependent variableを含むデータセットを作る関数である。使用法tmerge(data1, data2, id, ..., tstart, tstop, options)引数data1 : 元と... 2017.03.29 {survival}
{survival} [R] 生存曲線のX軸(時間軸)の尺度を週、月、年単位などに変更する方法 背景のsurvival::plot.survfit()関数を使用して生存曲線を描画すると、デフォルトではX軸(時間軸)の単位はデータベースの単位となる。例えば日単位でデータベースを作っていれば、カプランマイヤー曲線のX軸も日単位ということで... 2016.09.01 {survival}
{survival} [R] {survival} number at risk テーブル付きのキャプランマイヤー曲線を描く方法 Rでは、{survival}パッケージのsurvfit()関数を使用して作成したモデル オブジェクトを引数としてplot()関数を実行することでキャプランマイヤー曲線を描画することができる。しかしながらこの方法では論文でよく見る numbe... 2016.05.11 {survival}
{survival} [R] {survival} summary.km()の出力の読み方 summary.km()を実行すると以下のような出力が得られます。 time n.risk n.event survival std.err lower 95% CI upper 95% CI 2.0 113 1 0.991 0.00881... 2016.04.07 {survival}
{survival} [R]{survival} coxph() : cox回帰分析を実行する関数 出力の解釈(注意点)Q. hazard ratioはどこに表示されるのか? exponential(coef)がハザード比である。即ち介入群/コントロール群のハザードの比である。 coefficient (coef) は読んで字のごとく回帰... 2015.10.01 {survival}